Theoretical Study of 31P chemical shielding tensors in B-DNA
| Název česky | Teoreticke studium tenzoru 31P chemickeho stineni v B-DNA |
|---|---|
| Autoři | |
| Rok publikování | 2004 |
| Druh | Článek v odborném periodiku |
| Časopis / Zdroj | Materials Structure |
| Fakulta / Pracoviště MU | |
| Citace | |
| www | odkaz na sbornik na internetu |
| Obor | Fyzikální chemie a teoretická chemie |
| Klíčová slova | NMR; DFT; 31P chemical shielding;B-DNA; isotropis chemical shielding; chemical shielding anisotropy; sugar-phosphate backbone |
| Popis | V nasi praci aplikujeme metodu funkcionalu hustoty (DFT) na vypocty tenzoru 31P chemickeho stineni v cukr-fosfatove pateri B-DNA. Cilem techto vypoctu je zhodnotit vliv velikosti torznich uhlu alfa, zeta a epsilon a vazebneho uhlu OPO na 31P isotropni chemicke stineni (CSI) a na anizotropii chemickeho stineni (CSA), ktere byly ziskany pomoci programu deMon. Vysledky ukazuji, ze 31P CSI i 31P CSA vzrustaji, jestlize alfa (zeta) roste z 270 na 330 stupnu (z 240 na 300 stupnu). CSI se v zavislosti na obou torznich uhlech pohybuje v rozmezi radu jen nekolika ppm. Naproti tomu dosahuji zmeny CSA az 30 ppm v pripade uhlu alfa a az 10 ppm v pripade uhlu zeta.. Toto vetsi rozmezi hodnot CSI/CSA ziskane pro uhel alfa (ve srovnani s uhlem zeta) ukazuje na vetsi citlivost 31P chemickeho stineni vuci torznimu uhlu alfa. Z grafu zavislosti CSI/CSA na alfa (zeta) lze videt, ze trendy CSI/CSA ziskane pro ruzne hodnoty uhlu zeta=240-300 stupnu (alfa=270-330 stupnu) jsou posunuty k vyssim hodnotam, jestlize zeta (alfa) roste z 240 na 300 stupnu (z 270 na 330 stupnu). Pozoruhodne je take to, ze zmeny v CSI vyvolane torznim uhlem epsilon jsou srovnatelne s temi, ktere pochazi od uhlu alfa a zeta. Naproti tomu zustava CSA uhlem epsilon temer neovlivnena. Z vypoctu dale plyne, ze trend zavislosti CSA na alfa koreluje se zmenami v OPO torznim uhlu, ke ktery pri obmenach torzniho uhlu alfa dochazi. |
| Související projekty: |