Nový častý polymorfismu 17654 C/T v genu pro trankripční represorový onkoprotein Gfi-1 u kožních T-lymfomů
| Autoři | |
|---|---|
| Rok publikování | 2004 |
| Druh | Článek ve sborníku |
| Konference | Sborník XXI. Sjezdu českých a slovenských alergologů a klinických imunologů, Brno, 2004, supp 2 |
| Fakulta / Pracoviště MU | |
| Citace | |
| Obor | Genetika a molekulární biologie |
| Klíčová slova | gene; Gfi-1; cutaneous T-cell lymphoma |
| Popis | Úvod: Gfi-1 kóduje transkripční represorový onkoprotein, původně i dentifikovaný inzerční mutagenezou s užitím retrovirových vektorů v myších T-lymfomech. Cílem práce bylo asociovat nově objevený polymorfismus 1765 C->T s výskytem kožních T-lymfomů v české populaci. Materiál a metody: Heteroduplexní analýzou potvrzenou kapilární i radioizotovou sekvenací jsme prokázali nový, dosud nepublikovaný polymorfismus 1765 C->T ve 3 oblasti genu pro Gfi-1. Následně jsme vyvinuli PCR metodu s restrikční analýzou pomocí enzymu AvrII, která umožňuje rychlou detekci tohoto polymorfismu na širších klinických souborech. Srovnali jsme genotypové distribuce a alelické frekvence tohoto polymorfismu mezi skupinou 61 pacientů s kožními T-lymfomy a skupinou 93 zdravých jedinců podobné struktury věku a pohlaví. Výsledky: Neprokázali jsme signifikantní rozdíl v alelických frekvencích vyšetřeného polymorfismu 1765 CT mezi pacienty s kožním T-lymfomem (T= 36.9%) oproti kontrolním osobám (T=44.1%; p=0.209). Neprokázali jsme ani signifikantní rozdíl v distribuci genotypů mezi pacienty s T-lymfomy a kontrolními subjekty (p=0.227, tab. 1). Prokázali jsme však, že odds ratio (OR) pro genotyp TT u pacientů s kožním T-lymfomem je 0.510, 95% CI=0.22-1.14, p=0.07. Genotyp TT polymorfismu 1765 CT v Gfi-1 genu tedy představuje potenciálně protektivní variantu pro kožní T-lymfom. Závěr: Předpokládá se, že Gfi-1 působí jako dominantní onkogen, který kooperuje s Myc a Pim-1 v procesu vzniku lymfomů. U alelické varianty T 1765 C->T polymorfismu dochází k zániku vazebného místa pro aktivátorový protein 1 (AP-1) ve 3 oblasti. Je zajímavé, že homozygotní genotyp pro tuto alelickou variantu (TT) je zřejmě asociován s nižším OR pro kožní T-lymfom. |
| Související projekty: |