On Simulating 3D Fluorescent Microscope Images

• Název česky: Simulace 3D fluorescenčních mikroskopických obrazových dat
• Autoři: SVOBODA David; KAŠÍK Marek; MAŠKA Martin; HUBENÝ Jan; STEJSKAL Stanislav; ZIMMERMANN Michal
• Rok publikování: 2007
• Druh: Článek ve sborníku
• Konference: Computer Analysis of Images and Patterns
• Fakulta / Pracoviště MU: Fakulta informatiky
• www: http://dx.doi.org/10.1007/978-3-540-74272-2_39
• Obor: Využití počítačů, robotika a její aplikace
• Klíčová slova: synthetic image; simulator; procedural texture; convolution; fluorescent optical microscope
• Popis: V posledních letech se objevila celá řada různých segmentačních technik vhodných pro biomedicínská obrazová data. Ačkoliv většina z těchto technik byla označována jako úspešných, jen málo jich bylo řádně testováno porovnáním výsledků s tzv. referečními daty. Většina z nich byla ověřena pouhým optickým porovnáním. V tomto článku je prezentován 3D simulátor schopný generovat syntetická data podobná těm, která jsou produkována při fluorescenční mikroskopii. Druhým neméně důležitým výstupem tohoto simulátoru jsou rovněž odpovídající referenční data vhodná právě k testování kvality libovolných segmentačních technik.

Související projekty

• Dynamika a organizace chromosomů během buněčného cyklu v normě a patologii
• Vytipování markerů, screening a časná diagnostika nádorových onemocnění pomocí vysoce automatizovaného zpracování multidimenzionálních biomedicínských obrazů