Genome size in Cyperaceae

Varování

Publikace nespadá pod Pedagogickou fakultu, ale pod Přírodovědeckou fakultu. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.

Název česky	Velikost genomu u šáchorovitých
Autoři	BUREŠ Petr ZEDEK František ŠMARDA Petr ROTREKLOVÁ Olga HRALOVÁ Ivana
Rok publikování	2008
Druh	Konferenční abstrakty
Fakulta / Pracoviště MU	Přírodovědecká fakulta
Citace
Popis	V čeledi Cyperaceae je detekce polyploidie komplikovaná chromosomálními fúzemi a fragmentacemi (symploidie a agmatoploidie) v důsledku holokineticé povahy chromosomů. Studujíc karyotyp velikost genomu u Cyperaceae, jsme kombinovali molekulární metody, flow cytometrii a počítání chromosomů u Carex a Eleocharis. Tyto rody kontrastují počtem druhů, evolučními centry, ekologickou diversifikací, ale hlavně variabilitou velikostí genomu a chromosomů, která je u Eleocharis jedna z největších mezi rody krytosemenných rostlin (od 8.1 do 296 Mbp). Analyzovali jsme genomické parametry: velikost genomu, počet chromosomů, velikost chromosomů, AT/GC poměr, Ty3-gypsy a Ty1-copia retrotransposonovou diversitu a množství. Evoluční dynamika těchto druhopvě specifických parametrů mapovaná na fylogenetické vztahy, vycházející ze sekvenčních markerů (ITS, trnL-F) byla použita pro zhodnocení role polyploidie, agmatoploidie, symploidie, a retrotransposonové aktivity.
Související projekty:	Diverzita biotických společenstev: kauzální analýza variability v prostoru a čase Centrum pro výzkum biodiverzity Evoluce GC obsahu a genomu trav