pKa Calculations of Key Ionizable Protein Residues in Acetylcholinesterase

Varování

Publikace nespadá pod Pedagogickou fakultu, ale pod Přírodovědeckou fakultu. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.

Autoři	WIESNER Jiří KŘÍŽ Zdeněk KOČA Jaroslav
Rok publikování	2010
Druh	Článek ve sborníku
Konference	UF5 - Book of Contributions
Fakulta / Pracoviště MU	Přírodovědecká fakulta
Citace
www	http://indico.cern.ch/conferenceDisplay.py?confId=69338%20[+]
Obor	Fyzikální chemie a teoretická chemie
Popis	One of the most abundant quantities characterising proteins is its isoelectric point, which is directly dependent on the number of charged ionizable residues, on the pKa of all ionizable residues more exactly. In this work, the pKa of buried protein aminoacids are estimated using method based on molecular dynamics called thermodynamic integration. The main scope is to compute pKa in acetylcholinesterase, but the computations on a small protein, thioredoxin, will be also presented as benchmark calculations.
Související projekty:	Molekulární a strukturní biologie vybraných cytostatik. Od mechanických studií k chemoterapii rakoviny REAKTIVACE - Výzkum reaktivace acetylcholinesterasy metodami výpočetní chemie