CAVER Viewer-new tool enhancing computation and visualization of channels in proteins

Logo poskytovatele

Varování

Publikace nespadá pod Pedagogickou fakultu, ale pod Fakultu informatiky. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.
Autoři

KOZLÍKOVÁ Barbora SOCHOR Jiří SZABÓ Tibor ZAMBORSKÝ Matúš

Rok publikování 2010
Druh Článek ve sborníku
Konference The IADIS Computer Graphics, Visualization, Computer Vision and Image Processing (CGVCVIP) 2010
Fakulta / Pracoviště MU

Fakulta informatiky

Citace
Obor Informatika
Klíčová slova CAVER; CAVER Viewer; visualization; protein; channel; molecular dynamics
Popis Tento článek popisuje možnosti aplikace CAVER Viewer, která se věnuje analýze a vizualizaci proteinových struktur. Právě díky specifické tvoří doplněk k již existujícím programům věnujícím se proteiovým strukturám. CAVER Viewer poskytuje rozhraní pro výpočet a analýzu tzv. tunelů v proteinech a zároveň obsahuje sadu tradičních i nových technik pro vizualizaci výsledků. Specifické struktury, které zkoumáme, jsou nazývany tunely. Jejich prozkoumání je umožněno spojením 3D zobrazení a dvoudimenzionální informace o tunelech v podobě grafových statistik. V porovnání s existujícími aplikacemi CAVER Viewer zpracovává rozsáhlé množiny dat reprezentující molekulovou dynamiku - pohyb a chování proteinu v čase.
Související projekty:

Používáte starou verzi internetového prohlížeče. Doporučujeme aktualizovat Váš prohlížeč na nejnovější verzi.