Dynamics of the base of ribosomal A-site finger revealed by molecular dynamics simulations and Cryo-EM.

Varování

Publikace nespadá pod Pedagogickou fakultu, ale pod Přírodovědeckou fakultu. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.
Název česky Dynamika ribosomálního A-site fingeru odhalená molekulově dynamickými simulacemi a Cryo-EM.
Autoři

RÉBLOVÁ Kamila RÁZGA Filip LI Wen GAO Haixiao FRANK Joachim ŠPONER Jiří

Rok publikování 2010
Druh Článek v odborném periodiku
Časopis / Zdroj Nucleic Acids Research
Fakulta / Pracoviště MU

Přírodovědecká fakulta

Citace
Obor Fyzikální chemie a teoretická chemie
Klíčová slova Kink-turn; RNA flexibility; Molecular Dynamics; Ribosome function
Popis Provedli jsme molekulově dynamické simulace ohnutých segmentů A-site fingeru z velké podjednotky archeálního ribozómu a ze třech velkých podjednotek ribozómů bakteriálních. Studie ukázala, že ačkoli mají studované ribozomální segmenty nekonzervované sekundární struktury, mají téměř identické prostorové uspořádání a vykazují podobné stochastické fluktuace. Geometrie segmentů ze simulací odpovídají strukturám, které byly získány pomocí kryo-elektronové mikroskopie.
Související projekty:

Používáte starou verzi internetového prohlížeče. Doporučujeme aktualizovat Váš prohlížeč na nejnovější verzi.