Kvantifikace proteinových biomarkerů pomocí hmotnostní spektrometrie pracující v režimu monitorování vybraných reakcí

Logo poskytovatele

Varování

Publikace nespadá pod Pedagogickou fakultu, ale pod Přírodovědeckou fakultu. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.
Autoři

FAKTOR Jakub STRUHÁROVÁ Iva FUČÍKOVÁ Alena HUBÁLEK Martin VOJTĚŠEK Bořivoj BOUCHAL Pavel

Rok publikování 2011
Druh Článek v odborném periodiku
Časopis / Zdroj Chemické listy
Fakulta / Pracoviště MU

Přírodovědecká fakulta

Citace
Obor Biochemie
Klíčová slova protein quantification; mass spectrometry; proteomics
Popis Monitorování vybraných reakcí (selected reaction monitoring, SRM) je kvantitativní hmotnostně-spektrometrická technika, která se stále více uplatňuje v kvantitativní analýze proteinů na bázi stanovení peptidů. Instrumentace sestává z nanoprůtokové kapalinové chromatografie spojené s ionizací elektrosprejem a hmotnostním spektrometrem na bázi trojitého kavdrupólu. První kvadrupól funguje jako hmotnostní filtr propouštějící vybraný peptid, který je fragmenován ve druhém kvadrupólu pomocí kolizí indukované disociace. Třetí kvadrupól propouští vybrané peptidové fragmenty, které následně dopadají na detektor. Tetnto přístup umož%nuje cílenou kvantifikaci desítek proteinů v jediné analýze s vysokou citlivostí a selektivitou. SRM se proto stává klíčovou metodou tzv. cílené proteomiky. Nejdůležitější aplikace spočívají ve výzkumu živých systémů kde SRM umožňuje rychlé, přesné a cenově přijatelné stanovení proteinů ve velkých počtech vzorků.
Související projekty:

Používáte starou verzi internetového prohlížeče. Doporučujeme aktualizovat Váš prohlížeč na nejnovější verzi.