Informace o projektu
Racionální re-design mikrobiálních enzymů podílejících se na degradaci toxických organických polutantů
- Kód projektu
- ME 276
- Období řešení
- 6/1998 - 12/2002
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR
- Program KONTAKT (ME + MEB) (jen po projekty s počátkem řešení v roce 2010)
- Fakulta / Pracoviště MU
- Přírodovědecká fakulta
The main objective of the project is the investigation of structure-function relationships of the enzymes involved in degradation of toxic substances - halogenated aliphatic hydrocarbons. The structures of the proteins from the family of haloalkane dehalogenases will be rationaly modified using the methods of genetic engineering. The impact of the changes in proteins structure on activity and specificity will be tested using steady-state kinetic measurements. Design of the mutant proteins will be conducted using computer modelling. Mutant proteins will be constructed using site-directed mutagenesis techniques. General structure-function relationships will be formulated from derived experimental data.
Publikace
Počet publikací: 18
2002
-
Biodegradation of 1,2,3-trichloropropane through directed evolution and heterologous expression of a haloalkane dehalogenase gene
Applied and Environmental Microbiology, rok: 2002, ročník: 68, vydání: 7
-
Exploring the structure and activity of haloalkane dehalogenase from Sphingomonas paucimobilis UT26: evidence for product and water mediated inhibition
Biochemistry, rok: 2002, ročník: 41, vydání: 15
-
Halide-stabilizing residues of haloalkane dehalogenases studied by quantum mechanic calculations and site-directed mutagenesis
Biochemistry, rok: 2002, ročník: 41, vydání: 48
-
Impact of Orthogonal Signal Correction (OSC) on the predictive ability of CoMFA models for the ciliate toxicity of nitrobenzenes
Quantitative Structure-Activity Relationships, rok: 2002, ročník: 21, vydání: 1
2001
-
Biochemical characterization of broad-specificity enzymes using multivariate experimental design and a colorimetric microplate assay: characterization of the haloalkane dehalogenase mutants
Journal of Microbiological Methods, rok: 2001, ročník: 44, vydání: 1
-
Molecular dissection of interactions between Rad51 and members of the recombination-repair group
Molecular and Cellular Biology, rok: 2001, ročník: 21, vydání: 3
-
Reaction mechanism and stereochemistry of gamma-hexachlorocyclohexane dehydrochlorinase LinA
Journal of Biological Chemistry, rok: 2001, ročník: 276, vydání: 11
-
TRITON: graphic software for rational engineering of enzymes
Trends in Biochemical Sciences, rok: 2001, ročník: 28, vydání: 1
2000
-
Dehalogenation of haloalkanes by Mycobacterium tuberculosis H37Rv and other mycobacteria
Applied and Environmental Microbiology, rok: 2000, ročník: 66, vydání: 1
-
Effect of the carbon source on assessment of degrading bacteria with the spread-plating technique during in situ bioremediation
Folia Microbiologica, rok: 2000, ročník: 45, vydání: 1