Komparativní analýza dvou odlišných linií plazmidů kódujících exfoliativní toxin B u klinických kmenů Staphylococcus aureus

Warning

This publication doesn't include Faculty of Education. It includes Faculty of Science. Official publication website can be found on muni.cz.
Title in English Comparative analysis of two distinct lineages of exfoliative toxin B encoding plasmids of Staphylococcus aureus clinical strains
Authors

BOTKA Tibor RŮŽIČKOVÁ Vladislava SVOBODOVÁ Karla PANTŮČEK Roman PETRÁŠ Petr ČEJKOVÁ Darina DOŠKAŘ Jiří

Year of publication 2017
Type Article in Proceedings
Conference XXVI. konference mladých mikrobiologů TOMÁŠKOVY DNY 2017
MU Faculty or unit

Faculty of Science

Citation
Web XXVI. Tomáškovy dny mladých mikrobiologů
Field Genetics and molecular biology
Keywords ETB plasmid, exfoliative toxin B, phylogeny, genome analysis
Description Schopnost některých kmenů S. aureus produkovat exfoliativní toxiny je podmíněna obsahem specifických mobilních genetických elementů. Z hlediska medicínské praxe jsou nejvýznamnější exfoliativní toxiny A a B, které jsou kódovány geny lokalizovanými na profágu, respektive plazmidu. V této práci byly charakterizovány plazmidy kódující exfoliativní toxin B (ETB plazmidy), které byly izolovány z klinických kmenů zodpovědných za hromadná epidermolytická onemocnění v českých porodnicích. Byla provedena genotypizace a restrikční analýza plazmidů i jejich hostitelských kmenů. Na základě sekvenční analýzy byla navržena multiplex PCR pro detekci všech sekvenčních typů ETB plazmidů. Sekvenování, multiplex PCR a komparativní analýza ukázaly, že většina ETB plazmidů sdílí společnou „core“ sekvenci, typickou přítomností genů pro bakteriociny, inhibitor epidermální diferenciace typu C či rezistenci ke kadmiu. Tvoří tak ucelenou linii (I), jejíž zástupce lze rozdělit do čtyř sekvenčních typů podle přítomnosti specifických genomových úseků. Ty jsou tvořeny replikačními geny či transpozony kódujícími rezistenci k antibiotikům. Všechny plazmidy této linie byly detekovány v kmenech klonálního komplexu CC121, které často obsahovaly i profága s genem pro exfoliativní toxin A. Z bezprofágového kmene sekvenčního typu ST130 byl izolován dosud nepopsaný typ ETB plazmidu, obsahující geny pro konjugaci a také nové varianty genů pro exfoliativní toxin B a další faktory virulence. Geny lokalizované v „core“ sekvenci linie I se u něj nevyskytují. Přestože se dosud předpokládalo, že ETB plazmidy jsou relativně uniformní, byl v této práci izolován a detailně popsán nový, sekvenčně zcela odlišný typ. Svými vlastnostmi tak reprezentuje novou dosud nepopsanou linii (II) ETB plazmidů, mající však velký vliv na patogenitu toxinogenních kmenů S. aureus.
Related projects:

You are running an old browser version. We recommend updating your browser to its latest version.