When Polyploidy is Going to Sleep: Tempo and Modes of Karyotype evolution in Holocentrics

Logo poskytovatele

Varování

Publikace nespadá pod Pedagogickou fakultu, ale pod Přírodovědeckou fakultu. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.
Název česky Když polyploidie jde spát: Tempo a mechanismy evoluce holocentrických karyotypů
Autoři

BUREŠ Petr ZEDEK František ŠMARDA Petr LIPNEROVÁ Ivana

Rok publikování 2012
Druh Konferenční abstrakty
Fakulta / Pracoviště MU

Přírodovědecká fakulta

Citace
Popis Na rozdíl od monocentrických chromosomů s velikostně omezeným kinetochorem, holocentrické chromosomy připojují mikrotubuly dělícího vřeténka ke kinetochorům, pokrývajícím většinu jejich vnějšího povrchu. Zatímco u monocentriků může být polyploidie snadno detekována na základě periodicity počtu chromozomů, u holocentriků je tento trend často maskován chromozomální fúzí/štěpením, které jsou považovány za klíčové mechanismy evoluce holocentrických karyotypů. I když je počítání chromosomů spojeno s měřením somatického obsahu DNA není to pro pro detekci polyploidie dostačující, neboť šíření/odstraňování repetitivní DNA je dalším významným mechanismem evoluce holocentrických karyotypů. Abychom vyřešili problém kvantifikace jednotlivých mechanismů, navrhli jsme model, který identifikuje čtyři možné mechanismy karyotypu evoluce v holocentrics (aneuploidie, polyploidie, fúze/štěpení chromosomů a proliferaci/odstraňování repetitivní DNA) pro danou fylogeneticky uspořádanou skupinu taxonů. Pomocí navrženého modelu jsme analyzovali 105 a 14 druhů holocentric rodů Carex a Eleocharis (Cyperaceae). Zatímco v Eleocharis, polyploidie je dominantní mechanismem odpovědným za 72% změn v evoluci velikosti genomu, u ostřic je to proliferace/odstraňování repetitivní DNA (75%).
Související projekty:

Používáte starou verzi internetového prohlížeče. Doporučujeme aktualizovat Váš prohlížeč na nejnovější verzi.