Proteome-wide dataset generated by iTRAQ-3DLCMS/MS technique for studying the role of FerB protein in oxidative stress in Paracoccus denitrificans

Logo poskytovatele
Logo poskytovatele
Logo poskytovatele

Varování

Publikace nespadá pod Pedagogickou fakultu, ale pod Přírodovědeckou fakultu. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.
Autoři

PERNIKÁŘOVÁ Vendula SEDLÁČEK Vojtěch POTĚŠIL David PROCHÁZKOVÁ Iva ZDRÁHAL Zbyněk BOUCHAL Pavel KUČERA Igor

Rok publikování 2015
Druh Článek v odborném periodiku
Časopis / Zdroj Data in Brief
Fakulta / Pracoviště MU

Přírodovědecká fakulta

Citace
Doi http://dx.doi.org/10.1016/j.dib.2015.06.015
Obor Biochemie
Klíčová slova Paracoccus denitrificans; 3DLC proteomics; FerB; iTRAQ; Microbial proteomics
Popis 3DLC protein- and peptide fractionation technique combined with iTRAQ-peptide labeling and Orbitrap mass spectrometry was employed to quantitate Paracoccus dentirificans total proteome with maximal coverage. This resulted in identification of 24948 peptides representing 2627 proteins (FDR<0.01) in P. dentirificans wild type and ferB mutant strains grown in the presence or absence of methyl viologen as an oxidative stressor. The data were generated for assessment of FerB protein role in oxidative stress as published by V. Pernikářová et al., Proteomic responses to a methyl viologeninduced oxidative stress in the wild type and FerB mutant strains of Paracoccus denitrificans, J Proteomics 2015;125:68-75. Dataset is supplied in the article.
Související projekty:

Používáte starou verzi internetového prohlížeče. Doporučujeme aktualizovat Váš prohlížeč na nejnovější verzi.