Computational Analysis of Large-Scale Multi-Affine ODE Models

Logo poskytovatele

Varování

Publikace nespadá pod Pedagogickou fakultu, ale pod Fakultu informatiky. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.
Název česky Výpočetní analýza rozsáhlých multiafinních ODE modelů
Autoři

BARNAT Jiří BRIM Luboš ČERNÁ Ivana DRAŽAN Sven FABRIKOVÁ Jana ŠAFRÁNEK David

Rok publikování 2009
Druh Článek ve sborníku
Konference International Workshop on High Performance Computational Systems Biology
Fakulta / Pracoviště MU

Fakulta informatiky

Citace
www https://ieeexplore.ieee.org/document/5298697
Obor Informatika
Klíčová slova biological networks; parallel model checking; dynamics systems; rectangular abstraction
Popis Biologický systém je chápán v systémové biologii jako síť biochemických interakcí mezi jednotlivými substancemi. Složitost takovýchto sítí je enormní. Při analýze dynamických vlastností biologických systémů je nezbytné čelit stavové explozi. V tomto článku je představen prototyp nástroje pro analýzu diskrétních abstrakcí dynamiky biologických systémů. Asbtrakce je chápána ve smyslu obdélníkové asbtrakce fázového prostoru systému diferenciálních rovnic. V článku jsou představeny paralelní algoritmy pro průzkum stavového prostoru a heuristiky usnadňující použitelnost obdélníkové abstrakce pro analýzu biochemických modelů.
Související projekty:

Používáte starou verzi internetového prohlížeče. Doporučujeme aktualizovat Váš prohlížeč na nejnovější verzi.