Genome size and base composition in Oryzaephilus surinamensis (Coleoptera: Sylvanidae) and differences between native (feral) and silo pest populations in Israel
| Název česky | Velikost genomu a genomický poměr bází u Oryzaephilus surinamensis (Coleoptera: Sylvanidae): rozdíly mezi přírodními a skladištními populacemi v Izraeli |
|---|---|
| Autoři | |
| Rok publikování | 2010 |
| Druh | Článek v odborném periodiku |
| Časopis / Zdroj | Journal of Stored Products Research |
| Fakulta / Pracoviště MU | |
| Citace | |
| www | http://www.sciencedirect.com/science?_ob=ArticleURL&_udi=B6T8Y-4X9NCD5-1&_user=835458&_coverDate=01%2F31%2F2010&_rdoc=1&_fmt=high&_orig=search&_sort=d&_docanchor=&view=c&_searchStrId=1249688928&_rerunOrigin=scholar.google&_acct=C000045159&_version |
| Obor | Botanika |
| Klíčová slova | Genome size; AT/CG; Oryzaephilus surinamensis; Wolbachia |
| Popis | Průtoková cytometrie byla použita pro stanovení a srovnání velikosti genomu a genomové složení bazí (poměr AT/GC) u skladištního brouka Oryzaephilus surinamensis (L.). V trávicím traktu tohoto brouka byla dále studována přítomnost endosymbiotické bakterie Wolbachia. Srovnáním s interními standardami s odpovídající velikostí genomu stanovenou sekvenováním (Oryza sativa subsp. japonica Nipponbare, Arabidopsis thaliana Columbia, samičí linie Drosophila melanogaster) byla haploidní velikost genomu stanovena v rozmezí od 151.5 do 154 Mbp u studovaného O. surinamensis. Tato velikost je dosud nejmenší známou velikostí u brouků (Coleoptera). U osmi skladištních populací byla velikost genomu signifikantně menší než u osmi přirozených populací živících se dubovými žaludy. Schopnost O. surinamensis kolonizovat různé habitaty může být spojena s neobvykle AT bohatým (ve srovnání s jinými bezobratlými) genomem (obsah AT-bazí kolísá od 68 do 76%). Přirozané (ferální) populace O. surinamensis jsou více geneticky diverzifikované než populace skladištní. |
| Související projekty: |