METODY V ZÁZNAMU, HODNOCENÍ A ZPRACOVÁNÍ GENOMICKÝCH SIGNÁLŮ FRAKTÁLY

Varování

Publikace nespadá pod Pedagogickou fakultu, ale pod Přírodovědeckou fakultu. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.

Autoři	VALLA Martin NEDVĚD Jiří PAVLÍK Dušan ADAM Vojtěch HUBÁLEK Jaromír TRNKOVÁ Libuše KIZEK René PROVAZNÍK Ivo
Rok publikování	2010
Druh	Článek ve sborníku
Konference	XIV.Setkání biochemiků a molekulárních biologů - sborník příspěvků
Fakulta / Pracoviště MU	Přírodovědecká fakulta
Citace
Obor	Biochemie
Klíčová slova	fractals; genomic DNA
Popis	Cílem projektu je uvedení do problematiky teorie fraktálů a aplikace těchto poznatků pro analýzu obrazů získaných ze sekvence DNA kódu. Pro analýzu byly vybrány genomové sekvence kódující proteiny s afinitou k iontům kovů (metalothionein, protein p53, metaloproteinaza). Výsledkem jsou fraktální koeficienty odvozené od dimenzí struktur. Ty nám dovolují zavést kritérium pro odlišení sekvencí, multifraktální koeficient. Výstup lze také reprezentovat jako více rozměrné zobrazovaní a záznam genomického signálu (1D, 2D a 3D). Všechny algoritmy byly vytvořeny v prostředí maticové laboratoře MATLAB.
Související projekty:	Centrum biofyzikální chemie, bioelektrochemie a bioanalýzy. Nové nástroje pro genomiku, proteomiku a biomedicínu