Constructing Phylogenetic Trees Based on Intra-Group Analysis of Human Mitochondrial DNA

Varování

Publikace nespadá pod Pedagogickou fakultu, ale pod Přírodovědeckou fakultu. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.

Název česky	Konstrukce fylogenetických stromů založená na vnitroskupinové analýze lidské mitochondriální DNA
Autoři	VOGEL Ivan ZEDEK František OČENÁŠEK Pavel
Rok publikování	2011
Druh	Článek ve sborníku
Konference	Lecture Notes in Computer Science
Fakulta / Pracoviště MU	Přírodovědecká fakulta
Citace
Doi	http://dx.doi.org/10.1007/978-3-642-21793-7_20
Obor	Informatika
Klíčová slova	Intra-group; mtDNA; neighbor joining; Phylogenetic trees; population divergence; position-specific clustering vector; substitution model
Popis	This paper describes a modified algorithm for inferring phylogenetic trees based on distance techniques. The input of the algorithm consists of predefined clusters of data. It uses a usual agglomerative approach, however it involves a novel technique for distance matrix creation as the task of clustering predefined groups of human mitochondrial DNA sequences should be fulfilled.
Související projekty:	Diverzita biotických společenstev: kauzální analýza variability v prostoru a čase Centrum pro výzkum biodiverzity Evoluce karyotypu a velikosti genomu v čeledi Cyperaceae