Constructing Phylogenetic Trees Based on Intra-Group Analysis of Human Mitochondrial DNA

Logo poskytovatele

Varování

Publikace nespadá pod Pedagogickou fakultu, ale pod Přírodovědeckou fakultu. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.
Název česky Konstrukce fylogenetických stromů založená na vnitroskupinové analýze lidské mitochondriální DNA
Autoři

VOGEL Ivan ZEDEK František OČENÁŠEK Pavel

Rok publikování 2011
Druh Článek ve sborníku
Konference Lecture Notes in Computer Science
Fakulta / Pracoviště MU

Přírodovědecká fakulta

Citace
Doi http://dx.doi.org/10.1007/978-3-642-21793-7_20
Obor Informatika
Klíčová slova Intra-group; mtDNA; neighbor joining; Phylogenetic trees; population divergence; position-specific clustering vector; substitution model
Popis This paper describes a modified algorithm for inferring phylogenetic trees based on distance techniques. The input of the algorithm consists of predefined clusters of data. It uses a usual agglomerative approach, however it involves a novel technique for distance matrix creation as the task of clustering predefined groups of human mitochondrial DNA sequences should be fulfilled.
Související projekty:

Používáte starou verzi internetového prohlížeče. Doporučujeme aktualizovat Váš prohlížeč na nejnovější verzi.