Informace o projektu
Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím
- Kód projektu
- MSM0021622413
- Období řešení
- 1/2005 - 12/2011
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR
- Výzkumné záměry
- Fakulta / Pracoviště MU
-
Přírodovědecká fakulta
- prof. RNDr. Jaroslav Koča, DrSc.
- Další fakulta/pracoviště MU
-
Středoevropský technologický institut
- Klíčová slova
- proteiny, vztah struktury a funkce proteinů, komplexy proteinů, proteom, metabolom
Návrh bezprostředně navazuje na předchozí výzkumný záměr "Strukturně funkční vztahy biomolekul a jejich role v metabolismu", řešený v letech 1998-2004, a zčásti i na projekt "Laboratoř struktury a dynamiky biomolekul" v rámci programu "250" (1996-2000). Klíčovou součástí tohoto výzkumného záměru byla identifikace a charakterizace vybraných bakteriálních proteinů a nízkomolekulárních látek účastnících se metabolismu bakterií a hub. Nově navrhovaný záměr by měl jednak zahrnout i další proteiny z jiných typů organismů, např. živočišné proteiny vážící feromony, ale hlavním přínosem bude rozšíření předmětu zájmu na interakce proteinů s okolím. Řečeno jinak, hlavní inovací bude to, že předmětem zájmu budou komplexy proteinů. Při studiu funkce a regulace enzymů se zaměříme i na rozvoj metod monitorování jejich aktivity za podmínek in vivo analýzou intracelulárních metabolitů. Zapojení odborníků z oblasti instrumentální analytické chemie a experimentální organické chemie a fotochemie umožní neomezovat se na, z pohledu řady metod, „uživatelský přístup“, ale vyvíjet vlastní aktivity k dalšímu rozvoji a implementaci těchto technik v proteomice a metabolomice. Nový záměr bude moci stavět na instrumentální základně, kterou se v minulém období podařilo výrazně posílit. Např. v letech 2001-2002 bylo sdružením prostředků z fondu SZNN MŠMT, minulého výzkumného záměru a grantu GAČR vybudováno moderní pracoviště pro analýzu proteomu, zahrnující dvoudimenzionální elektroforézu, denzitometrii s analýzou obrazu a hmotnostní spektrometrii proteinů. Vynikající je také strukturní a počítačové zázemí projektu, a to jak z hlediska instrumentálního tak z hlediska lidských zdrojů. Výrazně byla inovována molekulárně biologická infrastruktura záměru (např. zřízena nová laboratoř pro studium interakce rostlin s patogeny). Těmito změnami se otevírá pole využití moderních metod genomiky, proteomiky a metabolomiky při akcentaci biochemického a strukturního pohledu na řešenou problematiku. Celková hodnota investičních zařízení, která budou v rámci řešení výzkumného záměru používána, přesahuje částku 100 mil. Kč. Investiční úsilí podávaného výzkumného záměru bude sledovat základní myšlenku udržet alespoň rámcově krok v oblasti instrumentace používané v té části současné moderní biochemie a strukturní biologie, která se zabývá proteiny. K základním cílům výzkumného záměru v oblasti personální bude udržet na fakultě mladé kvalitní výzkumné pracovníky, kteří buď byli fakultou vychováni či na fakultu přišli v rámci vládních programů na posílení výzkumu na vysokých školách či výzkumných center.
Publikace
Počet publikací: 834
2010
-
Unraveling an FNR based regulatory circuit in Paracoccus denitrificans using a proteomics-based approach
Biochimica et Biophysica Acta - Proteins and Proteomics, rok: 2010, ročník: 1804, vydání: 6, DOI
-
Use of 125I-labeled iodothyronines as tools for studies of Fluoxetine interaction with the metabolism of triiodothyronine
Rok: 2010, druh: Další prezentace na konferencích
-
Use of 82Br and 131I radionuclides in studies of thyrotoxic effects of exogenous bromide
Rok: 2010, druh: Další prezentace na konferencích
-
Validation of capillary electrophoretic method for in-capillary metabolism of dextromethorphan
Chiranal 2010, rok: 2010
-
Využití kapilární elektroforézy pro studium enzymů
Rok: 2010, druh: Vyžádané přednášky
-
Vývoj radiometrických metod pro stanovení enzymových aktivit jodothyronin dejodas: Vliv antidepresiva fluoxetinu na aktivity dejodas typu 1, 2 a 3 v mozku potkana
Radioanalytické metody IAA 09 (Vobecký M., ed.), rok: 2010
-
Why acetylcholinesterase reactivators do not work in butyrylcholinesterase
Journal of Enzyme Inhibition and Medicinal Chemistry, rok: 2010, ročník: 25, vydání: 3
2009
-
.: Keyhole-Lock-Key Model: Engineering of Tunnels in Proteins with Buried Active Sites
Rok: 2009, druh: Vyžádané přednášky
-
1H, 13C and 15N nuclear magnetic resonance coordination shifts in Au(III), Pd(II) and Pt(II) chloride complexes with phenylpyridines
Magnetic Resonance in Chemistry, rok: 2009, ročník: 47/47, vydání: 6
-
A global benchmark study using affinity-based biosensors
Analytica Chimica Acta, rok: 2009, ročník: 386, vydání: 2