Informace o projektu
Studium kódu CTD RNA polymerázy II
- Kód projektu
- GA13-18344S (kod CEP: GA13-18344S)
- Období řešení
- 2/2013 - 12/2017
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Grantová agentura ČR
- Standardní projekty
- Fakulta / Pracoviště MU
- Středoevropský technologický institut
Navrhuji objasnit základní pravidla, která používají RNA procesující faktory pro rozpoznávání tzv. CTD kódu RNA polymerázy II. Koncept CTD kódu, který urcuje pozici RNA polymerázy v transkripcním cyklu a rídí interakce se specifickými procesujícími
faktory byl navrhnut témer pred 10 lety. Snaha odhalit strukturu CTD a její interakce s cetnými vazebnými faktory byla neúspešná v predchozích krystalografických pokusech z duvodu flexibility CTD a její slabé vazebné afinite k procesujícím
faktorum. V tomto projektu urcíme NMR struktury nekolika procesujících faktoru navázaných na CTD s ruznými modifikacními znackami. Nedávný vývoj v oblasti SAXS technik, které lze nyní kombinovat s vysoce rozlišenými NMR strukturami, nám umožní
objasnit dlouhodobou otázku jak vazba procesujících faktoru mení strukturu CTD. Použití této technologie poskytne zcela nové strukturní informace k objasnení CTD kódu, což významne posune hranice poznání v oboru transkripce a procesování RNA.
Publikace
Počet publikací: 3
2017
-
Structural insight into recognition of phosphorylated threonine-4 of RNA polymerase II C-terminal domain by Rtt103p
EMBO reports, rok: 2017, ročník: 18, vydání: 6, DOI
-
Structure and dynamics of the RNAPII CTDsome with Rtt103
Proceeding of the National Academy of Sciences of the USA, rok: 2017, ročník: 114, vydání: 42, DOI
2014
-
Molecular Basis for Coordinating Transcription Termination with Noncoding RNA Degradation
Molecular Cell, rok: 2014, ročník: 55, vydání: 3, DOI