Informace o projektu
Studium proteinu z patogenu zapojených do rozpoznávání hostitelského organismu
- Kód projektu
- GA13-25401S
- Období řešení
- 2/2013 - 12/2017
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Grantová agentura ČR
- Standardní projekty
- Fakulta / Pracoviště MU
- Přírodovědecká fakulta
Sacharidy jsou v živote nepostradatelné a krome jejich klasické role jako strukturních a energii uchovávajících látek, hrají
klícovou úlohu v mnoha rozpoznávacích signalizacních ci komunikacních procesech. Interakce mezi proteiny a sacharidy se
významne uplatnují pri virových a bakteriálních infekcích, ci v nádorových metastázích. Projekt je primárne zameren na lektiny
a adheziny z bakteriálních patogenu a vláknitých plísní prenášených vzduchem a jejich interakce s lidskými olidosacharidovými
epitopy prítomnými v dýchacích cestách.
Navrhujeme multidisciplinární prístup studia interakcí mezi proteiny a sacharidy, smerující k prevenci adheze patogenu k hostitelským tkáním. Kombinace pokrocilých strukturne funkcních metod umožní provedení racionálního návrhu glykomimetik,
které by mohly inhibovat prichycení patogenu k povrchu bunek a tím pádem být slibnými ligandy predevším pro patogeny
resistentní ke klasické lécbe antibiotiky.
Publikace
Počet publikací: 43
2016
-
Different QM/MM Approaches To Elucidate Enzymatic Reactions: Case Study on ppGalNAcT2
Journal of Chemical Theory and Computation, rok: 2016, ročník: 12, vydání: 12, DOI
-
FleA Expression in Aspergillus fumigatus Is Recognized by Fucosylated Structures on Mucins and Macrophages to Prevent Lung Infection
PLoS Pathog, rok: 2016, ročník: 12, vydání: 4, DOI
-
Characterization of lectins from Photorhabdus luminescens to reveal their function in entomopathogenic complex with Heterorhabditis bacteriophora
Rok: 2016, druh: Další prezentace na konferencích
-
Lectins with beta-propeller fold in opportunistic pathogens
Rok: 2016, druh: Konferenční abstrakty
-
Structural and functional determination of predicted core fucose specific mutants of Ralstonia solanacearum lectin
Rok: 2016, druh: Konferenční abstrakty
-
Structure and function of Photorhabdus asymbiotica lectins: Studies of potential virulence factors from emerging human pathogen
Rok: 2016, druh: Konferenční abstrakty
2015
-
A point mutation led to overturn in sugar-binding specificity of lectin RS-IIL from PA-IIL lectin superfamily
Rok: 2015, druh: Konferenční abstrakty
-
AtomicChargeCalculator: Interactive Web-based calculation of atomic charges in large biomolecular complexes and drug like molecules
Journal of Cheminformatics, rok: 2015, ročník: 7, vydání: 50, DOI
-
Evaluation of Selected Classical Force Fields for Alchemical Binding Free Energy Calculations of Protein-Carbohydrate Complexes
Journal of Chemical Theory and Computation, rok: 2015, ročník: 11, vydání: 7, DOI
-
High-quality and universal empirical atomic charges for chemoinformatics applications
Journal of Cheminformatics, rok: 2015, ročník: 7, vydání: DEC, DOI