Informace o projektu
Molekulární typizace kmenů a izolátů Treponema pallidum subsp. Pallidum: základ pro epidemiologickou a klinickou identifikaci jednotlivých kmenů
- Kód projektu
- NR8967
- Období řešení
- 1/2006 - 12/2009
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Ministerstvo zdravotnictví ČR
- Resortní program výzkumu a vývoje - MZ
- Fakulta / Pracoviště MU
-
Lékařská fakulta
- prof. MUDr. David Šmajs, Ph.D.
- Mgr. Petra Pospíšilová, Ph.D.
- prof. MUDr. Jan Šmarda, DrSc.
- Klíčová slova
- Treponema pallidum, srovnávací genomika, PCR diagnostika, nukleotidové polymorfismy
- Spolupracující organizace
-
Fakultní nemocnice U sv. Anny Brno
- Odpovědná osoba doc. MUDr. Vladana Woznicová, Ph.D.
- Odpovědná osoba Mgr. Monika Dvořáková Heroldová, Ph.D.
- Odpovědná osoba prof. MUDr. Miroslav Votava, CSc.
- Odpovědná osoba MUDr. Jana Račovská
Projekt předpokládá vyšetření desítek až set kmenů a izolátů pddruhu T. pallidum ssp. apllidum v hypervariabilních oblastech genomu. Rozdíly v těchto sekvencích budou použity pro identifikaci individuálních kmenů tohoto poddruhu.
Rozdíly v genomech kmenů a izolátů poddruhu T. pallidum ssp. pallidum budou zjišťovány po PCR amplifikaci sekvenací PCR produktů. Bude navržen zjednodušený protokol na identifikaci nejčastějších kmenů na základě PCR aplifikace a RFLP.
Publikace
Počet publikací: 90
2009
-
Macrolide treatment failure in a case of secondary syphilis: a novel A2059G mutation in the 23S rRNA gene of Treponema pallidum subsp. pallidum.
Journal of Medical Microbiology, rok: 2009, ročník: 58, vydání: 6
-
Mapování sekvenčních rozdílů u rodu Treponema.
XIII. Setkání biochemiků a molekulárních biologů., rok: 2009
-
Molekulárně biologická diagnostika původce syfilis Treponema pallidum subsp. pallidum v klinickém materiálu.
Rok: 2009, druh: Konferenční abstrakty
-
Molekulární detekce lokusu makrolidové rezistence u klinických izolátů syfilis v České republice.
Rok: 2009, druh: Konferenční abstrakty
-
Nová strategie sekvencování celého genomu patogenních spirochet.
XIII.Setkání biochemiků a molekulárních biologů. Sborník příspěvků., rok: 2009
-
Přínos PCR pro diagnostiku časné syfilidy.
Rok: 2009, druh: Další prezentace na konferencích
-
Rezistence T. pallidum k makrolidům (diagnostika a kazustika).
Rok: 2009, druh: Konferenční abstrakty
-
Screening of macrolide resistance locus in Treponema pallidum subsp. pallidum in the Czech Republic.
Clinical Microbiology and Infection, Abstracts of the 19th ECCMID, P698, rok: 2009
-
Srovnání genomů původců yaws s genomem kmene Nichols, původcem syfilis.
XIII. Setkání biochemiků a molekulárních biologů. Sborník příspěvků., rok: 2009
-
Syfilis, diagnostika a kmenová typizace.
Rok: 2009, druh: Konferenční abstrakty