Přejít k obsahu | Přejít k hlavnímu menu | Přejít k vyhledávání

Informace o projektu
Studium molekulárních mechanismů adaptace bakterií na změny prostředí pomocí proteomických technik

Informace

Projekt nespadá pod Pedagogickou fakultu, ale pod Přírodovědeckou fakultu. Oficiální stránka projektu je na webu muni.cz.
Logo poskytovatele
Kód projektu
GP203/07/P471
Období řešení
1/2007 - 12/2009
Investor / Programový rámec / typ projektu
Grantová agentura ČR
  • Postdoktorské projekty
Fakulta / Pracoviště MU
Přírodovědecká fakulta
Klíčová slova
proteomová analýza, bakteriální adaptace, molekulární mechanismy, Paracoccus denitrificans

Podstatou projektu je zejména posouzení vlivu tří známých regulačních proteinů na proteom bakterie Paracoccus denitrificans v procesech adaptace na změny vnějšího prostředí. Je známo, že tyto proteiny působí jako senzory pro kyslík a dusíkaté terminální akceptory elektronů. Po vytvoření databáze k identifikaci proteinů na základě nedávno zpřístupněné genomové sekvence bakterie bude provedena podrobná proteomová studie, srovnávající vliv mutací genů pro regulační proteiny na expresi ostatních proteinů v celobuněných lyzátech. Proteiny budou separovány dvourozměrnou gelovou elektroforézou a identifikovány hmotností spektrometrií. Proteiny se změnami v expresi budou dále podrobeny bioinformatické analýze, u vybraných proteinů budou doplněny funkční analýzy (stanovení enzymových aktivit a hladin mRNA). Ke komplementárnímu srovnáni proteinového složení membránových frakcí bude vybrána a testována nová metoda na bázi kapalinové chromatografie a hmotnostní spektrometrie. Vytvořená dtabáze přeloženého genomu bude rovněž využita k identifikaci proteinů z dřívějších studií. Získané výsledky budou po publikaci použity k doplnění veřejné proteomové 2-D databáze P.denitrificans (http://www.mpiib-berlin.mpg.de/2D-PAGE/).

Publikace

Počet publikací: 8

2011

2010

2009

2008

Používáte starou verzi internetového prohlížeče. Doporučujeme aktualizovat Váš prohlížeč na nejnovější verzi.