Project information
Mapování výskytu makrolidové rezistence původce syfilis v ČR a molekulární typizace jednotlivých syfilitických kmenů

Information

This project doesn't include Faculty of Education. It includes Faculty of Medicine. Official project website can be found on muni.cz.

Project Identification

NT11159

Project Period

9/2010 - 12/2014

Investor / Pogramme / Project type

Ministry of Health of the CR

MU Faculty or unit

Faculty of Medicine

Cooperating Organization

National Institute of Public Health Prague 10 - Vinohrady

Responsible person Ing. Jana Kalinová, Ph.D.

Celogenomová sekvenace několika kmenů Treponema pallidum (TP, t.j. kmenů
Nichols, SS14, Mexico A a DAL-1) umožnila vývoj vysoce specifické PCR
diagnostiky TP. PCR detekce treponemální DNA umožňuje identifikovat
kmenově specifické genomové sekvence a také geneticky vyšetřovat citlivost
na některá antibiotika. Cílem projektu je sběr klinických vzorků z ČR a to
zejména anogenitálních stěrů a vzorků plné krve. Z těchto vzorků budeme
izolovat treponemální DNA, kterou budeme po amplifikaci sekvenovat (ve
variabilních chromosomálních lokusech). Navíc budeme molekulárně
biologicky určovat rezistenci k makrolidovým antibiotikům a klindamycinu.
Sekvence získané z různých izolátů TP budou srovnány a profil
jednonukleotidových záměn, delecí a inzercí bude využit pro shlukovací
analýzu treponemálních izolátů a pro epidemiologické účely. Dále budeme
vyvíjet rychlejší a levnější diagnostické testy pro molekulární typizaci
původce syfilis.

Publications

Total number of publications: 24

2013

Comparison of CDC and sequence-based molecular typing of syphilis treponemes: tpr and arp loci are variable in multiple samples from the same patient

MIKALOVÁ Lenka POSPÍŠILOVÁ Petra WOZNICOVÁ Vladana KUKLOVA Ivana ZAKOUCKA Hana ŠMAJS David

Article in Periodical

BMC Microbiology, year: 2013, volume: 13, edition: 178, DOI
Is there a difference between hare syphilis and rabbit syphilis? Cross infection experiments between rabbits and hares

LUMEIJ Johannes T. MIKALOVÁ Lenka ŠMAJS David

Article in Periodical

Veterinary Microbiology, year: 2013, volume: 164, edition: 1-2, DOI
Resequencing of Treponema pallidum ssp. pallidum Strains Nichols and SS14: Correction of Sequencing Errors Resulted in Increased Separation of Syphilis Treponeme Subclusters

PĚTROŠOVÁ Helena POSPÍŠILOVÁ Petra STROUHAL Michal ČEJKOVÁ Darina ZOBANÍKOVÁ Marie MIKALOVÁ Lenka SODERGREN Erica WEINSTOCK George M. ŠMAJS David

Article in Periodical

PloS ONE, year: 2013, volume: 8, edition: 9, DOI
Structure of rrn operons in pathogenic noncultivable treponemes: sequence but not genomic position of intergenic spacers correlates with classification of Treponema pallidum and Treponema paraluiscuniculi strains

ČEJKOVÁ Darina ZOBANÍKOVÁ Marie POSPÍŠILOVÁ Petra STROUHAL Michal MIKALOVÁ Lenka WEINSTOCK George M. ŠMAJS David

Article in Periodical

Journal of Medical Microbiology, year: 2013, volume: 62, edition: 2, DOI
Whole Genome Sequence of the Treponema Fribourg-Blanc: Unspecified Simian Isolate Is Highly Similar to the Yaws Subspecies

ZOBANÍKOVÁ Marie STROUHAL Michal MIKALOVÁ Lenka ČEJKOVÁ Darina AMBROŽOVÁ Lenka POSPÍŠILOVÁ Petra FULTON Lucinda L. CHEN Lei SODERGREN Erica WEINSTOCK George M. ŠMAJS David

Article in Periodical

PLOS Neglected Tropical Diseases, year: 2013, volume: 7, edition: 4, DOI

2012

Genetic diversity in Treponema pallidum: Implications for pathogenesis, evolution and molecular diagnostics of syphilis and yaws

ŠMAJS David NORRIS Steven J. WEINSTOCK George M.

Article in Periodical

Infection, Genetics and Evolution, year: 2012, volume: 12, edition: 2, DOI
Sequencing-based Molecular Typing of Treponema pallidum Strains in the Czech Republic: All Identified Genotypes are Related to the Sequence of the SS14 Strain

FLASAROVÁ Magdalena POSPÍŠILOVÁ Petra MIKALOVÁ Lenka VALIŠOVÁ Zuzana DASTYCHOVÁ Eliška STRNADEL Radim KUKLOVÁ Ivana WOZNICOVÁ Vladana ZÁKOUCKÁ Hana ŠMAJS David

Article in Periodical

Acta Dermato-Venereologica, year: 2012, volume: 92, edition: 6, DOI
Whole Genome Sequence of Treponema pallidum ssp. pallidum, Strain Mexico A, Suggests Recombination between Yaws and Syphilis Strains

PĚTROŠOVÁ Helena ZOBANÍKOVÁ Marie ČEJKOVÁ Darina MIKALOVÁ Lenka POSPÍŠILOVÁ Petra STROUHAL Michal CHEN Lei QIN Xiang MUZNY Donna M. WEINSTOCK George M. ŠMAJS David

Article in Periodical

PLOS Neglected Tropical Diseases, year: 2012, volume: 6, edition: 9, DOI

2011

Bacteriocin genes among E. coli strains: the incidence depends on genotype and phenotype of E. coli strains

ŠMAJS David ŠTAUDOVÁ Barbora MICENKOVÁ Lenka ŠMARDA Jan VRBA Martin ŠEVČÍKOVÁ Alena VALIŠOVÁ Zuzana WOZNICOVÁ Vladana

Conference abstract

Year: 2011, type: Conference abstract
Molecular detection and typing of Treponema pallidum ssp. pallidum in clinical samples based on sequencing of TP0136, TP0548 and 23S rRNA genes

MIKALOVÁ Lenka POSPÍŠILOVÁ Petra FLASAROVÁ Magdalena VALIŠOVÁ Zuzana WOZNICOVÁ Vladana ZÁKOUCKÁ H. KUKLOVÁ I. ŠMAJS David

Conference abstract

Year: 2011, type: Conference abstract