Project information
Proteotypová klasifikace renálního karcinomu ve vztahu k prognóze a terapeutické odpovědi
- Project Identification
- NV19-08-00250
- Project Period
- 5/2019 - 12/2023
- Investor / Pogramme / Project type
-
Ministry of Health of the CR
- Ministry of Health Research Programme 2015 - 2022
- MU Faculty or unit
-
Faculty of Science
- doc. Mgr. Pavel Bouchal, Ph.D.
- Mgr. Pavla Bouchalová, Ph.D.
- Mgr. Lucia Janáčová, Ph.D.
- Mgr. Petr Lapčík, Ph.D.
- Cooperating Organization
-
University Hospital Pilsen
- Responsible person prof. MUDr. Milan Hora, Ph.D., MBA
- Responsible person MUDr. Ondřej Fiala, Ph.D.
- Responsible person doc. MUDr. Alexandr Poprach, Ph.D.
- Responsible person MUDr. Alice Hlobilková, Ph.D.
- Responsible person doc. MUDr. Radek Lakomý, Ph.D.
- Responsible person MUDr. Ján Podhorec
Renální karcinom (RCC) přestavuje závažné onkologické onemocnění s celosvětově nejvyšší incidencí v České republice, přičemž spolehlivé molekulární prognostické a prediktivní biomarkery nejsou dosud k dispozici. Pro jejich “high-throughput“ vyhledávání a validaci zavedeme novou metodiku digitálního biobankingu založenou na získávání proteinových fingerprintů (proteotypů) pomocí hmotnostní spektrometrie v tzv. “data independent acquisition” módu. S využitím nově zavedené techniky budou analyzovány dva velmi dobře charakterizované soubory nádorů, získaná data budou statisticky hodnocena s cílem nalézt: (i) proteinové biomarkery identifikující pacienty s lokalizovaným RCC avšak s vyšším rizikem, kteří by měli být detailněji sledováni, a (ii) proteinové biomarkery související se špatnou odpovědí metastatických nádorů ledvin na léčbu tyrosinkinasovými inhibitory v první linii. Očekáváme, že nalezené patterny, potenciální biomarkery, resp. potenciální terapeutické cíle pomohou přispět k zefektivnění terapie pacientů s nádory ledvin.
Publications
Total number of publications: 28
2024
-
Transmembrane glycoprotein GPNMB is a candidate predictive biomarker and potentially a therapeutic target in metastatic renal cell carcinoma
Year: 2024, type: Conference abstract
2023
-
Next generation proteomics identifies a potential protein marker of poor response to tyrosine kinase inhibitors in metastatic renal cell carcinoma
Year: 2023, type: Conference abstract
-
Proteotype classification of localized and metastatic renal cell carcinoma for prognosis and therapy response
Year: 2023, type: Conference abstract
-
Proteotype classification of metastatic and localized renal cell carcinomas for prognosis and therapy response
Year: 2023, type: Conference abstract
-
Proteotypová klasifikace renálního karcinomu
Year: 2023, type:
-
Transmembrane glycoprotein GPNMB is a potential marker of poor response of metastatic renal cell carcinoma to tyrosine kinase receptor inhibitor treatment
Year: 2023, type: Conference abstract
2022
-
A large-scale assay library for targeted protein quantification in renal cell carcinoma tissues
Proteomics, year: 2022, volume: 22, edition: 7, DOI
-
Current methods for studying metastatic potential of tumor cells
Cancer Cell International, year: 2022, volume: 22, edition: 1, DOI
-
DIA-MS identifies proteins associated with a poor response of metastatic renal cell carcinoma to tyrosine kinase inhibitor treatment
Year: 2022, type: Conference abstract
-
Characterization of the AGR2 Interactome Uncovers New Players of Protein Disulfide Isomerase Network in Cancer Cells
Molecular & Cellular Proteomics, year: 2022, volume: 21, edition: 2, DOI