Project information
Advanced sequencing methods for deciphering structural variants in cancer genome
- Project Identification
- NU21-08-00237
- Project Period
- 5/2021 - 12/2025
- Investor / Pogramme / Project type
-
Ministry of Health of the CR
- Ministry of Health Research Programme 2020 - 2026
- Subprogram 1 - standard
- MU Faculty or unit
- Central European Institute of Technology
- Cooperating Organization
-
University Hospital Brno-Bohunice
Moderní metody sekvenování DNA umožňují podrobné mapování nádorového genomu a identifikaci lézí, na něž je možné cílit protinádorovou léčbu. Sekvenování pomocí dlouhého čtení dovoluje charakterizovat přestavby genomu, které je obtížné přesně určit pomocí standardních metod nádorové cytogenetiky. Ve skupině pacientů s hematoonkologickými diagnózami chceme využít nové sekvenační metody pro zjištění organizace genomu a rekurentních přestaveb s cílem pochopit mechanismy vzniku aberací a určit jejich význam pro klinický průběh nemoci a odpověď na léčbu.
Sustainable Development Goals
Masaryk University is committed to the UN Sustainable Development Goals, which aim to improve the conditions and quality of life on our planet by 2030.
Publications
Total number of publications: 36
2022
-
In-frame deletions and insertions in the TP53 gene identified in leukemia patients result in p53 protein inactivation.
Year: 2022, type: Conference abstract
-
Long-read whole genomes sequencing used to detect complex chromosomal rearrangements
Year: 2022, type: Conference abstract
-
LYNX: A web-based bioinformatic tool for targeted next-generation sequencing data analysis and visualization in lymphoid malignancies.
Year: 2022, type: Conference abstract
-
Pathogenic germline variants of TP53 gene are rare in patients with chronic lymphocytic leukemia.
Year: 2022, type: Conference abstract
-
Přínos a úskalí sekvenačních metod v diagnostice hematologických malignit.
Year: 2022, type: Conference abstract
-
Realita zapojení molekulárně biologických metod do diagnostiky a stratifikace lymfoproliferativních onemocnění.
Year: 2022, type: Conference abstract
-
Současná role cytogenomiky v diagnostice a prognostické stratifikaci hematologických malignit.
Year: 2022, type: Conference abstract
2021
-
Cytogenetická a molekulárně biologická analýza nádorového genomu nemocných s chronickou lymfocytární leukémií rezistentních k léčbě inhibitory BTK.
Year: 2021, type: Conference abstract
-
Detailed analysis of treatment-related clonal evolution in CLL through the identification of abnormal molecular pathways.
Year: 2021, type: Conference abstract
-
Duplikace 8q24 v chronické lymfocytární leukémii: Cytogentická a molekulárně-biologická analýza aberací genu MYC.
Year: 2021, type: Conference abstract